Siyah kök çürüklüğü, havuç yetiştiriciliğinde yaygın bir hastalıktır ve Chalara elegans mantarı tarafından neden olunur. Bu hastalık, hasattan sonra da depolama sırasında ortaya çıkabilir.
Siyah kök çürüklüğünün belirtileri genellikle toprak seviyesinin hemen altında başlar. İlk olarak, enfekte olan kökler mat siyahımsı veya gri renk alır ve sonrasında yumuşamaya başlar. Bu yumuşama, köklerin çürümesine neden olur ve sonunda çürümüş kökler siyah bir görünüm alır. Bu hastalık ayrıca yapraklarda da lekelerin oluşmasına neden olabilir.
Siyah kök çürüklüğü, tohumda veya toprağın içinde uzun süre kalabilen mantar sporlarından kaynaklanır. Enfekte tohumların kullanılması veya hastalıklı bitkilerin yakınında yeni bitkiler dikilmesi de hastalığın yayılmasına neden olabilir.
Bu hastalıkla mücadele yöntemleri arasında enfekte bitkilerin hemen çıkarılması, hastalıklı bitki kalıntılarının yok edilmesi, toprağı dezenfekte etmek ve sağlıklı bitki materyali kullanmak yer alır. Ayrıca, havuçlar hasat edildikten sonra düşük sıcaklıklarda depolanmalıdır.
